Blood:新發(fā)現(xiàn)16個(gè)靜脈血栓栓塞的遺傳易感位點(diǎn)!
靜脈血栓栓塞(VTE)是一種高發(fā)病率和高死亡率的疾病。為進(jìn)一步深入了解促進(jìn)VTE發(fā)生的生理機(jī)制,研究人員對(duì)VTE患者進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)和全基因組關(guān)聯(lián)研究(TWAS)和基于全血和肝臟基因表達(dá)的全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)研究(TWAS)。
研究人員對(duì)18個(gè)隊(duì)列的30 234位VTE患者和172 122位對(duì)照的GWAS數(shù)據(jù)進(jìn)行Meta分析,來評(píng)估12 923 718個(gè)遺傳變異與VTE的相關(guān)性。研究人員從全血和肝組織來源的數(shù)據(jù)計(jì)算基因表達(dá)的變異預(yù)測(cè)分?jǐn)?shù),并評(píng)估其與VTE的相關(guān)性。對(duì)與新的VTE位點(diǎn)相關(guān)的性狀進(jìn)行孟德爾隨機(jī)化分析。
最終,研究人員從GWAS Meta分析中確定了34個(gè)VTE風(fēng)險(xiǎn)的獨(dú)立遺傳信號(hào),其中14個(gè)是新發(fā)現(xiàn)的。這包括11個(gè)新的相關(guān)的遺傳位點(diǎn)(C1orf198、PLEK、OSMR-AS1、NUGGC/SCARA5、GRK5、MPHOSPH9、ARID4A、PLCG2、SMG6、EIF5A、STX10),其中6個(gè)在3個(gè)已知基因中重復(fù)出現(xiàn),3個(gè)為新發(fā)現(xiàn)的獨(dú)立信號(hào)。
此外,TWAS還從全血和肝臟中發(fā)現(xiàn)了5個(gè)額外的基因表達(dá)水平在患者中存在差異,且不同于對(duì)照組的遺傳位點(diǎn)(全血:SH2B3、SPSB1、RP11-747H7.3、RP4-737E23.2;肝臟:ERAP1)。在部分GWAS位點(diǎn)上,研究人員還找到了新的和已知區(qū)域的VTE相關(guān)信號(hào)與eQTL信號(hào)共定位的提示證據(jù)。隨機(jī)化分析表明,血液特征可能是VTE的潛在危險(xiǎn)因素之一。
綜上所述,本研究確定了16個(gè)新的VTE易感位點(diǎn);其中部分位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)信號(hào)可能是通過臨近基因的表達(dá)介導(dǎo)的。
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